由于Exchange 2003与Windows的Active Directory联系十分紧密，建议您先进行Windows的升级，确认Windows升级成功之后，在进行Exchange的升级。
从Exchange 5.5升级到Exchange 2003，主要有以下的几种方法
1. 升级安装(In-place upgrade)
一般安装exchane5.5的服务器的硬件，都达不到运行exchange2003的要求，这种方法在实际种比较少的用到。
2．迁移安装(Swing upgrade)
3，新安装
创建新的Windows 2003域，再利用ADMT迁移用户，用ADC复制邮箱属性，用ExMerge迁移邮箱内容。
我今天给大家介绍的就是第二种和第三种的升级方法全新安装
第二种升级的方法 迁移安装
1.备份现有的系统信息，System state / Exchange Store
2.升级Windows NT4域到Windows 2003域。
升级过程包括以下步骤：
a规划并实现一个命名空间和DNS基础结构 b确定森林的功能
c升级运行Windows NT Server 4.0的服务器，或者原先作为主域控制器的服务器
d升级所有的备用域控制器
e转换组
f完成域的升级
g在较老的客户机上安装Active Directory客户端软件
3.安装ADC工具，将Exchange 5.5的数据导入到Active Directory中
4.在新的Windows 2003上安装Exchange 2003。安装时选择加入现有的Exchange5.5
5. 实施Exchange数据的迁移工作，使用 ExMerge 2000 从 Exchange Server 5.5 迁移到 Exchange Server 2003.
ExMerge 实用工具的主要用途是在站点、服务器和组织之间移动 Exchange 邮箱。如果无法执行就地迁移，运行Exchange 2003 的全新安装，然后使用 ExMerge 2000 合并 Exchange Server 5.5 中的数据。ExMerge 位于 Exchange 2000 和 Exchange 2003 安装光盘上的 Support 文件夹中。在Exchange 2003中 ExMerge 2003.（注：如果尚未安装 Exchange Server 5.5 的 Service Pack 3 (SP3) 或 Windows NT Server 4.0 的 Service Pack 6a (SP6a) High Encryption（128 位），请安装此二者中的任意一个。）
6． 让两台Exchange同时存在一段时间
7． 删除原有的Exchange/NT4 域控
第三种的升级方法 全新安装
安装新的DC1
1. 在旧域控上安装NT4作为BDC，运行Service Pack 6。NIC和硬件必须支持NT4和WINDOWS 2003。
2. 把DC1作为WIN2K Exchange5.5的一个WINS客户。
3. 使DC1连到 PDC。
4. 升级到Windows Server 2003，它将直接到DCPROMO，你选择去创建新的、名为NewDomain.com的域。
5. 运行服务包。注：要为网络连接做计划。
6. 确保旧域控Exchange 5.5用户被转成新域控制器中的Active Directory Users And Computers。
7. 运行CSVDE并输出所有的NewDomain.com内的Active Directory用户至Excel文件（这个提供了一些容错能力）。
8. 在DC1建立一个DNS服务器，该服务器的主区域作为NewDomain.com。
安装新的DC2
1. 安装Windows Server 2003和服务包。
2. 运行DCPromo并把DC2作为目前NewDomain.com域的一个附加的域管理器。
3. 把它作为WIN2K Exchange5.5的一个WINS用户。
4. 在DC2建立一个DNS服务器作为DC1的次级。
修改WIN2K Exchange5.5
1. 指定NewDC1或者2作为DNS resolution。
2. 找到那些在Exchange Server 5.5 管理角色中级别最高的用户。
将DC1同Exchange 集成
1. 把Exchange 5.5 Admin用户放到NewDomain.com的Domain Admins组，Enterprise Admins组，和Schema Admins组中。
2. 从Exchange 2003 Server安装光盘上安装Active Directory Connector。
3. 从WIN2K Exchange5.5创建连接协议。
4. 运行Active Directory Connector。
5. 检查Active Directory Users And Computers，并确保这些用户现在已经在他们的帐户权限列表里拥有了Exchange。
退出NT4 PDC
关闭它
退出NT4 BDC
关闭它
在DC1上安装Exchange 2003
1. 提高AD Users And Computers域功能级别到Native Windows 2000。
2. 安装IIS 6.0，包括NNTP、SMTP和ASP.NET 。
3. 安装Exchange Server 2003，
在第一屏选择“自动运行”。选择Exchange部署工具。这种方法帮助你的服务器为安装Exchange Server 2003做好准备。在这个过程中，你应该选择Co-existence With Mixed Mode，运行Forest Prep、Domain Prep、ADC Setup和ADC Tools（通过AD Connector管理控制台）。
加入一个新的DC
一旦你确认Exchange服务器开始运行，功能正常，你就可以把另一个成员服务器加入NewDomain.com，并且在其上安装Active Directory。然后，到NewDC1，重新运行DCPROMO（在这种情况下，它实际上是Active Directory的卸载软件），这样Exchange Server 2003就不再存在于域控制器上。这是最好的方法。另一个你会感兴趣的最好的方法是如何在Exchange Server 2003上，在不会丢失任何邮件功能的情况下，锁住IIS。